Unterschied zwischen zielgerichteten und nicht zielgerichteten Proteomics

Der Hauptunterschied zwischen zielgerichteten und nicht zielgerichteten Proteomik ist, dass Zielgerichtete Proteomik zielt darauf ab, die Abundanz eines bestimmten Proteins zu messen, während ungezielte Proteomik nicht auf ein bestimmtes Protein abzielt.

Proteomik ist die groß angelegte Untersuchung von Proteinen, deren Strukturen und Funktionen. Es untersucht das gesamte Proteinkomplement in einer Zelle, einem Gewebe oder einem Organismus unter bestimmten Bedingungen. Es gibt zwei Arten von Proteomics als zielgerichtete Proteomics und ungezielte Proteomics.

INHALT

1. Übersicht und Schlüsseldifferenz
2. Was ist gezielte Proteomik?
3. Was ist ungezielte Proteomik?
4. Ähnlichkeiten zwischen zielgerichteten und nicht zielgerichteten Proteomics
5. Side-by-Side-Vergleich - gezielte und nicht zielgerichtete Proteomik in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist gezielte Proteomik??

Wie der Name schon sagt, zielt Targeted Proteomics auf ein spezifisches Protein oder ein Peptid in einer komplexen Mischung von Proteinen zur Analyse ab. Dann analysiert es die Anwesenheit und Menge dieses vorgewählten spezifischen Proteins. Diese Methode ist nur für eine oder mehrere Proben möglich. Diese Methode eignet sich auch für eine bestimmte Gruppe von Proteinen. Dies führt zu präziseren, quantitativen und sensitiven Daten. Darüber hinaus liefert die Massenspektrometrie in Verbindung mit gezielten Proteomik genauere, zuverlässigere Messungen. Diese Methode verwendet für die Analyse ein Triple-Quadrupol-Massenspektrometer (QQQ).

Abbildung 01: Proteomik

Targeted Proteomics ist eine geeignete Methode, wenn Sie überprüfen möchten, ob ein Knockdown-Ziel tatsächlich niedergeschlagen ist oder wenn Sie ein bestimmtes Protein / Peptid im Blutserum, in der Hirnflüssigkeit oder im Zelllysat usw. quantifizieren möchten. Sie können es auch verwenden, wenn Sie möchten um zu überprüfen, ob ein bestimmtes Protein in Proben oder während eines Zeitverlaufsexperiments differentiell exprimiert wird.

Was ist ungezielte Proteomik??

Nicht zielgerichtete Proteomics zielen, wie der Name erwähnt, nicht auf ein bestimmtes Protein oder Peptid für die Analyse ab. Entdeckungsproteomik ist ein anderer Name für nicht zielgerichtete Proteomik. Tatsächlich handelt es sich um eine eher "globale" Analyse. Im Allgemeinen ist die Durchführung ungeteilter Proteomik die Beantwortung der Frage "Welches Protein oder welche Proteine ​​befinden sich in dieser Probe oder in mehreren Proben?". Diese Methode ist nicht als zielgerichtete Proteomik empfindlich. Es kann jedoch viele Proteine ​​einschließlich neuer Proteine ​​identifizieren und messen. Nicht zielgerichtete Proteomik kann sowohl quantitative als auch qualitative Messwerte liefern.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen zielgerichteten und nicht zielgerichteten Proteomics??

  • Sowohl zielgerichtete als auch ungezielte Proteomik messen Proteine ​​in Proben.
  • Sie sind wichtig für die Proteomanalyse.
  • Diese Methoden verwenden Massenspektrometrie.

Was ist der Unterschied zwischen gezielten und nicht zielgerichteten Proteomics??

Zielgerichtete Proteomik ist zunächst die Bestimmung der Anwesenheit und Menge eines bestimmten Proteins oder Peptids in einer komplexen Mischung von Proteinen. Nicht zielgerichtete Proteomik dagegen ist die quantitative und qualitative Untersuchung von Proteinen, die in einer Probe oder in Proben enthalten sind, ohne auf ein bestimmtes Protein zu zielen. Gezielte Proteomik wird mit vorgewählten oder zielgerichteten Proteinen durchgeführt, während ungezielte Proteomik durchgeführt wird, um die Arten von Proteinen in dieser Probe herauszufinden. Außerdem ist gezielte Proteomik empfindlicher als ungezielte Proteomik.

Zusammenfassung - Gezielte vs. ungerichtete Proteomik

Zusammenfassend sind gezielte und nicht zielgerichtete Proteomik zwei Arten von Proteinstudien. Wie ihre Namen vermuten lassen, zielt zielgerichtete Proteomik auf ein bestimmtes Protein ab, während ungezielte Proteomik nicht auf ein bestimmtes Protein abzielt. Das ist der Unterschied zwischen gezielten und ungezielten Proteomics.

Referenz:

1. "Targeted Proteomics". UC Davis Proteomics Core, Hier verfügbar.
2. "Proteomik / Einführung in die Proteomik". Musiktheorie / Modi - Wikibooks, offene Bücher für eine offene Welt, Hier verfügbar.

Bildhöflichkeit:

1. ”Proteomics” Von Xxl7441 in der englischen Sprache Wikibooks - Übertragen von en.wikibooks an Commons (Public Domain) über Commons Wikimedia